Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LY9Q9HBG7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LY9Q9HBG7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms