Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA38

ZMAT3, Zinc finger matrin-type protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMAT3Q9HA38 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZMAT3Q9HA38 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZMAT3Q9HA38 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZMAT3Q9HA38 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZMAT3Q9HA38 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ZMAT3Q9HA38 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZMAT3Q9HA38 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZMAT3Q9HA38 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZMAT3Q9HA38 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZMAT3Q9HA38 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZMAT3Q9HA38 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZMAT3Q9HA38 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZMAT3Q9HA38 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZMAT3Q9HA38 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZMAT3Q9HA38 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZMAT3Q9HA38 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZMAT3Q9HA38 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms