Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1orf50Q9BV19 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms