Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms