Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RPUSD4Q96CM3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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