Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf62Q8N4C0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms