Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GREB1Q4ZG55 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms