Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Q1T7F1 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Q1T7F1 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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