Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ZNF56Q15929 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms