Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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