Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3GAP1Q15042 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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