Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PEX6Q13608 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PEX6Q13608 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PEX6Q13608 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PEX6Q13608 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PEX6Q13608 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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PEX6Q13608 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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PEX6Q13608 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PEX6Q13608 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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