Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE3BQ13370 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE3BQ13370 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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