Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRDNQ13061 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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