Protein–RNA interactions for Protein: P55316

FOXG1, Forkhead box protein G1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1P55316 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXG1P55316 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXG1P55316 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms