Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2A1P52655 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2A1P52655 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms