Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB9AP51151 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms