Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PITPNBP48739 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms