Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GTF2E2P29084 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2E2P29084 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms