Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB2P29033 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJB2P29033 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJB2P29033 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GJB2P29033 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJB2P29033 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms