Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR2CP19387 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR2CP19387 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms