Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABRA1P14867 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABRA1P14867 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms