Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGTAO43765 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGTAO43765 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGTAO43765 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGTAO43765 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SGTAO43765 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGTAO43765 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGTAO43765 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms