Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GRID1Q9ULK0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GRID1Q9ULK0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRID1Q9ULK0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRID1Q9ULK0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRID1Q9ULK0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRID1Q9ULK0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRID1Q9ULK0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRID1Q9ULK0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRID1Q9ULK0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms