Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms