Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOR4AQ9NXH8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms