Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BATF3Q9NR55 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms