Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.578e-11■■■■■ 169.2
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.397e-19■■■■■ 169.2
UTP3Q9NQZ2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.248e-11■■■■■ 169.2
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-203ENST00000345133 1088 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.757e-19■■■■■ 169.2
UTP3Q9NQZ2 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.568e-8■■■■■ 169.2
UTP3Q9NQZ2 TGIF1-214ENST00000549546 820 ntTSL 55.26□□□□□ -1.577e-19■■■■■ 169.2
UTP3Q9NQZ2 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.598e-8■■■■■ 169.2
UTP3Q9NQZ2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 169.2
UTP3Q9NQZ2 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 169.2
UTP3Q9NQZ2 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 169.2
UTP3Q9NQZ2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.352e-9■■■■■ 169.2
UTP3Q9NQZ2 AKT2-203ENST00000391844 1795 ntTSL 1 (best)26.24■■□□□ 1.793e-7■■■■■ 169.1
UTP3Q9NQZ2 AKT2-240ENST00000584288 1706 ntTSL 221.18■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 169.1
UTP3Q9NQZ2 PCYT1A-209ENST00000441879 724 ntTSL 316.99■□□□□ 0.313e-7■■■■■ 169.1
UTP3Q9NQZ2 PCYT1A-201ENST00000292823 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 169.1
UTP3Q9NQZ2 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.333e-7■■■■■ 169.1
UTP3Q9NQZ2 TCOF1-214ENST00000515035 5240 ntTSL 215.71■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 169.1
UTP3Q9NQZ2 TCOF1-213ENST00000514442 5195 ntTSL 214.91□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 169.1
UTP3Q9NQZ2 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 168.9
UTP3Q9NQZ2 HECTD3-206ENST00000486296 812 ntTSL 513.26□□□□□ -0.299e-11■■■■■ 168.9
UTP3Q9NQZ2 KRT8-210ENST00000548998 918 ntTSL 519.32■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 168.8
UTP3Q9NQZ2 KRT8-204ENST00000546826 1165 ntTSL 518.58■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 168.8
UTP3Q9NQZ2 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.217e-7■■■■■ 168.7
UTP3Q9NQZ2 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.37e-7■■■■■ 168.7
UTP3Q9NQZ2 ERCC3-206ENST00000462306 963 ntTSL 1 (best)16.93■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 168.7
UTP3Q9NQZ2 ERCC3-202ENST00000426778 2916 ntTSL 215.77■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 168.7
UTP3Q9NQZ2 ERCC3-203ENST00000445889 2920 ntTSL 215.56■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 168.7
UTP3Q9NQZ2 ERCC3-209ENST00000494464 1367 ntTSL 1 (best)13.96□□□□□ -0.176e-7■■■■■ 168.7
UTP3Q9NQZ2 ERCC3-201ENST00000285398 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 168.7
UTP3Q9NQZ2 FBXW11-210ENST00000522507 306 ntTSL 322.46■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 168.6
UTP3Q9NQZ2 FBXW11-204ENST00000517395 636 ntTSL 322.4■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 168.6
UTP3Q9NQZ2 RRBP1-207ENST00000468428 2200 ntTSL 217.82■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 168.6
UTP3Q9NQZ2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 168.6
UTP3Q9NQZ2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 168.6
UTP3Q9NQZ2 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 168.6
UTP3Q9NQZ2 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.046e-7■■■■■ 168.6
UTP3Q9NQZ2 COA1-219ENST00000490251 2135 ntTSL 29.53□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 168.6
UTP3Q9NQZ2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.876e-7■■■■■ 168.5
UTP3Q9NQZ2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 168.5
UTP3Q9NQZ2 LZTR1-211ENST00000479606 3442 ntTSL 214.64□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 168.5
UTP3Q9NQZ2 PTPA-212ENST00000417728 967 ntTSL 310.71□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 168.4
UTP3Q9NQZ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.95e-7■■■■■ 168.3
UTP3Q9NQZ2 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.322e-7■■■■■ 168.3
UTP3Q9NQZ2 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.732e-7■■■■■ 168.3
UTP3Q9NQZ2 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 168.3
UTP3Q9NQZ2 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 168.2
UTP3Q9NQZ2 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.11e-8■■■■■ 168.2
UTP3Q9NQZ2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 168.2
UTP3Q9NQZ2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.842e-7■■■■■ 168.2
UTP3Q9NQZ2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 168.2
UTP3Q9NQZ2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.361e-6■■■■■ 168.1
UTP3Q9NQZ2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 168.1
UTP3Q9NQZ2 P4HA2-204ENST00000379100 2563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 168.1
UTP3Q9NQZ2 P4HA2-205ENST00000379104 2569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 168.1
UTP3Q9NQZ2 P4HA2-207ENST00000401867 3349 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 168.1
UTP3Q9NQZ2 P4HA2-203ENST00000379086 2223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 168.1
UTP3Q9NQZ2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.774e-7■■■■■ 168.1
UTP3Q9NQZ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.837e-7■■■■■ 168.1
UTP3Q9NQZ2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.447e-7■■■■■ 168.1
UTP3Q9NQZ2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.437e-7■■■■■ 168.1
UTP3Q9NQZ2 CLPTM1L-202ENST00000503042 3540 ntTSL 211.94□□□□□ -0.57e-7■■■■■ 168.1
UTP3Q9NQZ2 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.969e-11■■■■■ 168
UTP3Q9NQZ2 STK24-206ENST00000481288 656 ntTSL 316.26■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 168
UTP3Q9NQZ2 SUPT5H-201ENST00000359191 3770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 167.9
UTP3Q9NQZ2 SUPT5H-213ENST00000598725 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.585e-7■■■■■ 167.9
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC12-210ENST00000441983 683 ntTSL 316.1■□□□□ 0.176e-7■■■■■ 167.9
UTP3Q9NQZ2 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.047e-7■■■■■ 167.8
UTP3Q9NQZ2 PGD-202ENST00000460189 767 ntTSL 214.09□□□□□ -0.157e-7■■■■■ 167.8
UTP3Q9NQZ2 PGD-205ENST00000483936 680 ntTSL 512.26□□□□□ -0.457e-7■■■■■ 167.8
UTP3Q9NQZ2 MRPS34-203ENST00000569585 713 ntTSL 215.37■□□□□ 0.055e-13■■■■■ 167.8
UTP3Q9NQZ2 FNDC3A-206ENST00000541916 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.776e-7■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 FNDC3A-203ENST00000484074 6082 ntTSL 1 (best)5.06□□□□□ -1.66e-7■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 BAIAP2-209ENST00000572329 2133 ntTSL 216.78■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL3-223ENST00000479383 873 ntTSL 317.76■□□□□ 0.435e-7■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL3-220ENST00000461066 692 ntTSL 511.24□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL3-235ENST00000532911 700 ntTSL 57.84□□□□□ -1.155e-7■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.375e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TMEM150A-204ENST00000417791 915 ntTSL 529.03■■■□□ 2.245e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 LNPK-203ENST00000409660 2028 ntTSL 1 (best)27.48■■□□□ 1.993e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TMEM150A-208ENST00000433956 821 ntTSL 327.45■■□□□ 1.985e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.985e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.945e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.875e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 FADS3-209ENST00000529525 530 ntTSL 326.71■■□□□ 1.873e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TOLLIP-209ENST00000528719 669 ntTSL 426.29■■□□□ 1.83e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.795e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TAF10-204ENST00000532344 638 ntTSL 225.58■■□□□ 1.695e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 TMEM150A-209ENST00000444380 1810 ntTSL 525.49■■□□□ 1.675e-9■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ARMT1-202ENST00000483931 742 ntTSL 324.22■■□□□ 1.475e-8■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.443e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.413e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.383e-13■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.372e-25■■■■■ 167.7
UTP3Q9NQZ2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.372e-25■■■■■ 167.7
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1158.7 ms