Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDGFDQ9GZP0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms