Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms