Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms