Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP36Q96G28 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms