Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GATAD2BQ8WXI9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms