Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC82Q8N4S0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms