Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYT9Q86SS6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms