Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPOCD1Q6ZMY3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms