Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AGAP9Q5VTM2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms