Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms