Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCB5Q2M3G0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms