Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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CNGA3Q16281 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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CNGA3Q16281 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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CNGA3Q16281 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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CNGA3Q16281 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNGA3Q16281 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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