Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1AQ13111 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1AQ13111 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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