Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFT88Q13099 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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