Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P63121 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms