Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAV3P56539 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAV3P56539 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAV3P56539 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms