Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIP4K2AP48426 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms