Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMB5P28074 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms