Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD46P15529 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD46P15529 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD46P15529 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD46P15529 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD46P15529 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CD46P15529 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD46P15529 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD46P15529 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD46P15529 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD46P15529 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms