Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC3O60481 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms