Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4O00268 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4O00268 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4O00268 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4O00268 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4O00268 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4O00268 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4O00268 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4O00268 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4O00268 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4O00268 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4O00268 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4O00268 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4O00268 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4O00268 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4O00268 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF4O00268 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF4O00268 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF4O00268 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF4O00268 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF4O00268 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF4O00268 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF4O00268 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF4O00268 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TAF4O00268 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4O00268 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4O00268 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4O00268 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4O00268 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4O00268 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF4O00268 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms