Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOC4-APOC2K7ER74 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2K7ER74 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms